Příloha III obsahuje seznam zemí (Island, Norsko, Švýcarsko, Lichtenštejnsko), na které se odkazuje v některých článcích Dohody a v Příloze I. V příloze IV je uveden seznam právních předpisů EU, ze kterých vyplývají minimální požadavky, jichž má být dosaženo v některých oblastech upravených v Dohodě (články 13 až 20). Konkrétní požadavky v souvislosti s jednotlivými předpisy jsou obsahem Přílohy VI. Příloha V stanovuje základní bázi frekvencí u některých linek mezi EU a Izraelem, což souvisí s postupným navyšováním frekvencí podle Přílohy II. Příloha VI obsahuje minimální regulatorní požadavky a standardy, jichž má být dosaženo při aplikaci právních předpisů EU, uvedených v Příloze IV Dohody. Svým usnesením ze dne 6. února 2013 č. 91 vyslovila vláda České republiky (ČR) souhlas se sjednáním Dohody. Před jejím podpisem přijala Rada EU rozhodnutí Rady a zástupců vlád členských států, zasedajících v Radě, o podpisu jménem Evropské unie a prozatímním provádění Dohody. Dohoda byla následně podepsána dne 10. června 2013 v Lucemburku během zasedání Rady ministrů dopravy ČS. Za českou stranu ji podepsal Ing. Zbyněk Stanjura, toho času ministr dopravy, za EU Leo Varadkar, ministr dopravy, cestovního ruchu a sportu Irska (předsednictví v Radě EU) a Siim Kallas, místopředseda EK a komisař pro dopravu. Za izraelskou stranu Dohodu podepsal ministr dopravy Israel Katz. Rozhodnutí Rady o uzavření Dohody bude moci být přijato až po obdržení souhlasu Evropského parlamentu a ukončení ratifikačních procesů ve všech členských státech EU. Text Dohody je v souladu s ústavním pořádkem a ostatními součástmi právního řádu ČR, se závazky vyplývajícími z členství ČR v EU, se závazky převzatými v rámci jiných platných smluv a s obecně uznávanými zásadami mezinárodního práva. Návrh nemá negativní dopady na problematiku rovnosti mužů a žen, ani na otázky ochrany životního prostředí. Sjednání Dohody nevyžaduje změny v českém právním řádu. Dohoda obsahuje aspekty, které spadají jak do výlučné působnosti EU, tak do výlučné působnosti členských států. Z unijně právního pohledu se tak jedná o dohodu smíšené povahy. To znamená, že s ohledem na rozdělení pravomocí mezi EU a její členské státy pozitivně právně zakotvené v zakládacích smlouvách může EU provádět samostatně jen část závazků vyplývajících z této Dohody, zatímco v ostatních částech potřebuje EU součinnost svých členských států. Právní základ pro podpis Dohody je dán čl. 100 odst. 2 ve spojení s čl. 218 odst. 5 a čl. 218 odst. 8 prvním pododstavcem Smlouvy o fungování EU a pro uzavření Dohody čl. 100 odst. 2 ve spojení s čl. 218 odst. 6 písm. a) a čl. 218 odst. 8 prvním pododstavcem Smlouvy o fungování Evropské unie. Z pohledu českého ústavního práva má Dohoda charakter mezinárodní smlouvy prezidentské kategorie ve smyslu čl. 49 písm. a) a e) Ústavy ČR, neboť upravuje práva a povinnosti osob (např. čl. 2, 3 a 8 upravující práva leteckých dopravců) a další věci, jejichž úprava je vyhrazena zákonu (např. čl. 9 a 14 upravující cla, daně a poplatky a ochranu před protiprávními činy). Vnitrostátně je projednána jakožto mezinárodní smlouva ve smyslu čl. 2 písm. a) bod 2 Směrnice vlády ke sjednávání mezinárodních smluv v rámci Evropské unie a k jejich vnitrostátnímu projednávání, která je přílohou k usnesení vlády č. 6 ze dne 9. ledna 2008 (dále jen „Směrnice vlády“). Dohoda se před ratifikací prezidentem republiky předkládá Parlamentu ČR k vyslovení jeho souhlasu s ratifikací. Ratifikovaná Dohoda bude v ČR vyhlášena ve Sbírce mezinárodních smluv. Tím se stane v souladu s čl. 10 Ústavy ČR součástí právního řádu ČR. Sjednání a provádění Dohody nebude mít dopad na výdaje státního rozpočtu. Uvedené činnosti budou zajišťovány především Ministerstvem dopravy a Úřadem pro civilní letectví (ÚCL), které budou v případě potřeby spolupracovat s ministerstvy zahraničních věcí, financí, práce a sociálních věcí, průmyslu a obchodu a životního prostředí. Administrativní a správní výdaje s tím spojené budou hrazeny z rozpočtů jednotlivých ministerstev a ÚCL. Vztahy mezi ČR a Izraelem v oblasti civilního letectví jsou upraveny Dohodou mezi vládou České a Slovenské Federativní Republiky a vládou Státu Izrael o letecké dopravě (dále jen „Dohoda o letecké dopravě“) podepsanou v Jeruzalémě dne 24. dubna 1991, která vstoupila v platnost dne 21. srpna 1991. Dále byl sjednán Protokol mezi vládou České republiky a vládou Státu Izrael o změně Dohody mezi vládou České a Slovenské Federativní Republiky a vládou Státu Izrael o letecké dopravě, podepsané v Jeruzalémě dne 24. dubna 1991, který byl podepsán v Praze dne 17. května 2012. Dohoda o letecké dopravě byla uvedena do souladu s právem Evropské unie Dohodou mezi Evropským společenstvím a Státem Izrael o některých aspektech leteckých služeb, která byla podepsána v Bruselu dne 9. prosince 2008 a vstoupila v platnost dne 4. listopadu 2009. Přímé letecké spojení mezi oběma státy je celoročně zajišťováno leteckým dopravci obou stran a zájem o rozšiřování provozu roste zejména z české strany. Vzhledem k stále ještě v některých aspektech restriktivní bilaterální smluvní úpravě ČR plně podporuje sjednání Dohody. Bude stanoven jednotný liberální smluvní rámec pro provoz leteckých služeb mezi EU a Izraelem a má být dosaženo určitého stupně regulační spolupráce, což přispěje k dalšímu rozvoji letecké dopravy mezi EU a Izraelem. Jak již bylo zmíněno v úvodu, Izrael je součástí postupného vytváření evropsko-středomořského leteckého prostoru mezi EU a zeměmi v oblasti Středozemního moře. Dohoda je dalším významným krokem v tomto úsilí.
V Praze dne 24. února 2014
Mgr. Bohuslav Sobotka, v.r. Předseda vlády